办理上海消防工程师证书，需要准备以下资料进行申报：

1. 身份证原件及复印件：办理者需提供有效期内身份证，同时提交身份证复印件一份。

2. 学历证书原件及复印件：办理者需具有国家承认的专科及以上学历，提供学历证书原件及复印件一份。

3. 工作证明：办理者需提供从事消防安全技术工作的单位出具的工作证明，证明内容包括工作年限、职务等信息。

4. 消防工程师职业资格证书原件及复印件：办理者需提供有效的消防工程师职业资格证书，同时提交复印件一份。

5. 近期免冠彩色照片：办理者需提供近期免冠彩色照片若干张，具体要求以当地消防部门的规定为准。

6. 申报表：办理者需填写完整的消防工程师证书申报表，表中内容需真实、准确。

7. 体检报告：办理者需提供近半年的体检报告，证明身体健康，符合从事消防工程师工作的条件。

8. 培训证明：办理者需提供参加消防工程师培训的证明，证明已具备相关知识和技能。

9. 职称证书（如有）：办理者如有相关职称证书，可提供原件及复印件一份。

注意事项：

1. 以上资料需真实、完整，如有虚假，将影响办理结果。

2. 办理过程中，请密切关注当地消防部门的通知，按时提交所需资料。

3. 办理周期根据当地消防部门的工作安排而定，请耐心等待。

4. 如有疑问，可向当地消防部门咨询，获取详细的办理指南。

希望以上信息对您有所帮助，祝您办理顺利！