1. 主管机构不同
CIA投资项目分析师的主管机构是人力资源和社会保障部教育培训中心。CIPA投资项目分析师的主管机构是中国商业联合会商业技能鉴定指导中心。
2. 颁发的证书不同
CIA投资项目分析师颁发的证书是人力资源和社会保障部教育培训中心的职业岗位能力证书，属于国家级证书(封面印有国徽); CIPA投资项目分析师颁发的是中国商业联合会商业技能鉴定中心的证书，属于社团法人级别的证书。
3. 所属行业不同
CIA投资项目分析师属于投资行业，行业主管部门是国家发改委; CIPA投资项目分析师属于商业领域，行业主管部门是中国商业联合会;
4. 培训的目的不同
CIA投资项目分析师培训的目的是使培训对象具备从事投资银行、IPO、兼并重组、项目融资的专业技能; CIPA投资项目分析师培训的目的是使培训对象具备从事商品生产、商品流通、饮食、服务业的商业技能。