您好！关于您儿子在日本留学的问题，这是一个需要综合考虑多方面因素的决策。以下是我根据您的情况给出的一些建议：

1. 分析目前情况：
- 您儿子目前的留学生和托福考试成绩不理想，这可能影响他申请到顶尖大学的机会。
- 日本的大学一般有春季和秋季入学两个批次，现在可能是秋季入学的准备阶段。

2. 今年的选择：
- 如果今年上一所普通大学，可以先将就一下，争取在大学期间提高自己的学术成绩和语言能力，为以后申请更好的研究生院校打下基础。
- 在普通大学就读期间，可以更多地了解日本的教育体系，适应日本的学习和生活环境，为将来更好的发展做准备。

3. 明年再考的考虑：
- 如果选择明年再考，您儿子可以有更多的时间准备托福考试，争取取得更好的成绩，提高申请到理想大学的几率。
- 但同时也要考虑到，明年考试的压力和竞争可能会更大，需要做好充分的准备。

建议：

- 如果您儿子对今年的考试信心不足，且家庭经济条件允许，可以考虑今年上一所普通大学，同时在大学期间努力提高自己。
- 如果您儿子有信心在短时间内提高成绩，且愿意承担一定的风险，可以选择明年再考。

综合考虑，关键在于您儿子的个人意愿、实际水平和家庭情况。希望这些建议能对您有所帮助，祝您儿子在日本留学之路上一帆风顺！