南京审计学院一本与二本的区别是专业不同，教学资源不同，毕业后就业待遇不同。

南京审计学院（简称：南审），2019年11月18日更名为南京审计大学，是江苏省属重点建设高校。学校与国家审计署同时诞生，与中国审计事业同步发展，是中国唯一以"审计"命名的高等学府，是中国审计高等教育发源地之一。南京审计学院在不同省份的招生和录取批次情况是不一样的，所以要根据自己的生源归属地来区分一本还是二本。

南京审计大学起源于1983年的南京财贸学院。1987年更为南京审计学院，由审计署和南京市人民政府联办。1991年转制为审计署直属。2000年办学体制调整为江苏省人民政府与审计署合作共建，以江苏省人民政府管理为主。2002年南京金融高等专科学校并入，组建新的南京审计学院。2019年11月更名为南京审计大学。