一、 思想上独立
（一） 管理层思想上肯定内部审计的独立地位
要想保证内部审计的独立性，关键取决于领导者对内部审计的认识程度和对内审工作的重视程度。管理层要重视内部审计工作，把内审部门作为企业管理的重要组成部分，内部审计是基于加强内部管理与调控的内在需要而产生与发展的，它是一种管理权的延伸，是代表管理权的审计，是内部控制的重要组成部分。只有确立内部审计的重要地位，内部审计才能卓有成效的独立开展工作，管理层的支持是独立性存在的前提条件。
（二） 审计人员保持独立性思想
审计人员在审计工作中始终要保持精神上的独立，是独立性得以存在的根本条件，要求审计人员有坚定的政治立场，较高的思想水平，针对经济领域不断出现的新问题，新情况保持清醒头脑，公正、无偏见的执行审计活动，评价审计成果。在进行审计评价时尊重客观事实，能够从客观公正的立场上去发现问题、分析问题、提出恰当的审计建议，客观、公正的行使审计监督权，不以自己的主观臆断和个人思想感情随意下结论。
二、 实质上独立
（一） 组织机构独立
内部审计机构的设置要独立，隶属关系上，应在各职能部门之上，提高审计人员的职务，应该尽可能接受董事会或总经理的领导，能保证内部审计较强的对立性。一些企业的内审部门在总会计师或主管财务副总经理的领导下工作，致使内部审计独立性较差，而有的内审部门只是其他职能部门的下属机构，或者是与其他部门联合办公，导致内部审计部门与其他部门互相牵制，难以独立的展开经济监督活动，独立性便无从说起。
（二） 人员独立
内部审计人员应是专门的审计人员，不是由其他部门的工作人员或其他管理人员兼任，这样在制定审计计划、实施审计程序、出具审计报告时可以不受各方面利益的牵制，不受任何部门和个人的干涉，独立的开展活动，出具客观公正的审计结论。而审计人员也应该不断提高自己的专业胜任能力，以适应现代经济对内部审计的高层次要求，这样才能不断提高审计质量，降低审计风险，用优异的工作成绩来保障其独立性。
（三） 经济独立
内部审计既不像国家审计有财政经费支持，也不像社会审计可以有审计收入，而内部审计的经费是企业的日常支出，要保证内部审计客观公正的独立展开工作，就要使内部审计的经费不受被审计对象的控制、影响。设有内部审计的部门在职工福利、升迁、考核和工作环境及硬件设施的各方面也应多考虑内审人员，提高其经济待遇，稳定内审队伍，用相对独立的工作环境和稳定的审计队伍来保障内部审计的独立性。