清华大学深圳研究生学院和北京研究生校区有以下几点区别：

1. 地理位置：清华大学深圳研究生学院位于深圳市南山区，而北京研究生校区则位于北京市海淀区。

2. 学院设置：清华大学深圳研究生学院是清华大学在深圳设立的研究生院，主要面向深圳及周边地区的学生招生，开设了信息与通信工程、电子与计算机工程、生物医学工程、材料科学与工程、经济管理等专业；北京研究生校区则是清华大学主校区的研究生院，包括了清华大学的大部分研究生专业。

3. 师资力量：清华大学深圳研究生学院和北京研究生校区的师资力量都非常强大，但因为学院设置和专业设置的不同，两个校区的教授和研究生导师也有所不同。

4. 学术氛围：北京研究生校区是清华大学的主校区，拥有更加浓厚的学术氛围和更多的学术资源；而清华大学深圳研究生学院则是新建的校区，学术氛围相对较为年轻和活跃。

5. 校园环境：北京研究生校区占地面积较大，校园环境优美，设施完备；清华大学深圳研究生学院则位于深圳市中心，校园环境较为紧凑，但也有现代化的教学设施和舒适的学生宿舍。