1. 超二级机构(secondary structure):指的是蛋白质中的局部结构,由氢键相连的肽链段形成的空间构型,包括α-螺旋、β-折叠、无规卷曲等结构。
2. 模体(motif):指的是蛋白质中的一种功能或结构单元,由若干个氨基酸残基组成,具有一定的空间结构和生物学功能,如螺旋-环-螺旋(helix-turn-helix)模体、锌指(zinc finger)模体等。
3. 结构域(domain):指的是蛋白质中的一个相对独立的结构单元,具有一定的空间结构和生物学功能,通常由若干个超二级结构和模体组成,可单独折叠成稳定的结构,如免疫球蛋白结构域、酸性磷酸酶结构域等。
因此,超二级机构是蛋白质中的基本结构单元,模体是蛋白质中的功能或结构单元,而结构域是蛋白质中的相对独立的结构和功能单元,三者之间存在一定的层次关系。
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