尊敬的朋友，关于您的疑问，二级建造师证书如果连续三年没有进行注册，并不会自动过期作废。但是，根据相关规定，二级建造师证书需要定期进行继续教育和注册，以保证证书的有效性。

以下是详细的解答：

1. **证书有效性**：二级建造师证书本身具有一定的有效期，通常在获得证书后的几年内需要完成继续教育并注册，才能保持其有效性。

2. **注册要求**：根据建设部门的规定，二级建造师应在规定的时间内完成注册，未注册期间是不能以二级建造师的身份参与工程项目管理的。

3. **继续教育**：二级建造师在注册前，通常需要完成一定学时的继续教育，这是保持证书有效的一个条件。

- 如果证书持有者在规定时间内未进行继续教育，可能会导致证书暂时失效。
- 若超过三年未注册，但完成了规定的继续教育学时，仍然可以申请注册。

4. **重新注册**：如果因为某些原因导致证书三年未注册，通常情况下，只要完成了规定的继续教育，并满足其他注册条件，可以申请重新注册。

5. **注意事项**：由于各地的具体规定可能有所不同，建议您咨询当地的住房和城乡建设部门，获取最准确的指导和帮助。

总之，您的二级建造师证书三年未注册并不意味着完全作废，只要尽快完成继续教育并按照当地规定进行注册，仍然可以恢复证书的有效性。希望我的回答能够帮助到您，如果有其他疑问，也欢迎随时咨询。祝您工作顺利！