尊敬的提问者，关于二级建造师延期注册超过时间的问题，您可以按照以下步骤进行处理：

1. **了解情况**：
首先，需要明确延期注册超期的时间长短。根据不同地区的规定，对于超期时间有不同的处理措施。

2. **收集材料**：
准备好二级建造师注册证书、身份证、延期申请表等相关材料，并确保这些材料的有效性。

3. **咨询当地建设行政主管部门**：
由于各地的具体规定可能有所不同，建议您联系当地的建设行政主管部门或者负责二级建造师注册管理的机构，了解具体的补办流程和所需材料。

4. **申请补办**：
如果超期时间在允许范围内，您需要按照当地部门的指引提交超期注册的申请。可能需要提交的情况说明和承诺书等。

- **情况说明**：说明造成注册超期的原因，如不可抗力因素等。
- **承诺书**：承诺在一定期限内完成相应的注册手续。

5. **缴纳罚金**：
根据规定，超期注册可能需要缴纳一定的罚金或滞纳金。请按照相关部门的指示进行缴纳。

6. **重新考试或培训**：
如果超期时间过长，可能需要重新参加相应的培训和考试才能恢复注册。

7. **注意时限**：
在处理延期注册的过程中，要注意新的时限要求，避免再次超期。

请您务必注意，以上步骤是基于一般情况提供的指导，具体的操作和流程以当地建设行政主管部门的规定为准。在整个处理过程中，保持与相关部门的良好沟通，并尽可能快速地准备和提交所需材料。

希望我的回答能够帮助到您，若还有其他疑问，欢迎随时提问。祝您问题顺利解决！