电子口岸操作员卡的申领办理流程：
1、到所属制卡代理点领取并如实填写2张表格，企业法人签字并加盖公章。它们分别是：《中国电子口岸企业情况登记表》、《中国电子口岸企业IC卡登记表》。
其中《中国电子口岸企业IC卡登记表》填写企业法人卡持卡人信息及企业操作员卡持卡人信息，申请企业法人卡只需填写“法人卡持卡人基本信息”栏，申请企业操作员卡需填写“操作员卡持卡人基本信息”栏及以下内容。企业如申请多张操作员卡，则须按照本企业指定的操作员人数每人填写一份。
2、由工商、税务、外贸、海关、外汇部门对企业用户进行资格审查，并购买了IC卡、读卡器、Oracle Lite软件以及向中国电信申请了17999帐号后，由制卡代理点为企业制作中国电子口岸企业法人卡和操作员卡。
资格审查所需携带的文件（正本或副本原件及复印件）包括：
1、《企业法人营业执照》或《企业营业执照》；
2、《税务登记证》或《外商投资企业税务登记证》；
3、《中华人民共和国进出口企业资格证书》或《中华人民共和国外商投资企业批准证书》；
4、《自理报关企业注册登记证》、《代理报关企业注册登记证》、《专业报关企业注册登记证》以及《报关员证》；
5、《中华人民共和国组织机构代码证》。