两者并不是一个学校。协和相当独立，协和的本科生基础课程等在清华里上，专业课啥的在协和上，毕业证书上有清华大学和北京协和医学院两个学校的章，协和学生公费出国啥的也是用清华的名额，协和不是211、985学校，但是因为清华的关系，所以毕业生在社会上都是看成985学校毕业生。不过要是学医的话，说协和毕业可能比985学校毕业名气更大哈。清华大学医学院是清华大学自己的一个学院，目前实力挺弱的，应该是清华想合并协和，但是没合并了，合作办学清华也没得到多少好处，所以就自己新办了医学院，这两个比较肯定是协和医学院好了。扩展资料：北京协和医学院-清华大学医学部2019年5月18日，中国协和医科大学正式更名为“北京协和医学院”；鉴于与清华大学紧密合作办学的需要，同时使用“北京协和医学院—清华大学医学部”的名称，接受教育部、卫生部双重领导，其原有的隶属领导关系、资产关系和经费管理体制保持不变，北京协和医学院仍为独立法人单位。2002年9月，教育部、卫生部两部领导签署了清华大学与中国协和医科大学紧密合作，共建“清华大学北京协和医学院”的协议，中国协和医科大学进入“211”和“985”工程建设项目。按照教育部卫生部2019年协议，中国协和医科大学正式更名为“北京协和医学院”；鉴于与清华大学紧密合作办学的需要，同时使用“北京协和医学院—清华大学医学部”的名称。中国协和医科大学与清华大学合作办学，但两校并未合并。北京协和医学院-清华大学医学部”中的“北京协和医学院”部分来自中国协和医科大学，北京协和医学院-清华大学医学部”中的“清华大学医学部”部分来自清华大学医学院。北京协和医学院-清华大学医学部。