尊敬的老师，关于您提出的问题，根据国际财务报告准则（IFRS）和中国企业会计准则的相关规定，以下是详细的解答：

在计算债券的摊余成本时，确实需要在减值已经发生的情况下才能扣除。以下是具体的处理流程：

1. **减值迹象的识别**：企业在每个财务报告期末，需要评估债券投资是否存在减值迹象。减值迹象可能包括债券发行方的信用评级下降、财务状况恶化、违约风险增加等。

2. **预计减值损失**：如果存在减值迹象，企业应估计未来可能无法收回的金额，即预计减值损失。

3. **减值损失确认**：在确定了预计减值损失后，只有当减值实际发生（即损失已经发生，而非仅仅是减值迹象出现），企业才允许在计算债券的摊余成本时扣除这部分损失。

- **如果减值已经发生**：此时，企业应当确认减值损失，将预计的损失金额从债券的面值中扣除，调整债券的账面价值。

- **如果仅是减值迹象**：在减值尚未实际发生时，根据谨慎性原则，企业不应直接扣除预计损失，因为这样可能会导致过早地减少资产价值。

4. **会计处理**：减值损失确认后，会体现在财务报表中，通常通过计提信用减值损失的方式处理。

总结来说，您提到的“发生减值迹象时不扣除”是正确的。只有在减值实际发生时，企业才能在计算债券摊余成本时扣除减值损失。

希望这个回答能够满足您的要求，如果还有任何疑问，欢迎继续提问。我会尽力提供准确、详细的解答。