税务机关对房地产企业所得税进行检查时，通常会采取以下步骤：

1. 资料准备：税务机关会要求房地产企业提供相关的财务会计资料、税务申报资料、合同协议、收支凭证等。

2. 税务调查：税务机关会对企业的财务、税务申报、合同协议等进行调查，了解企业的经营状况、收入情况、成本情况等。

3. 税务核算：税务机关会对企业的所得税核算情况进行核查，确认企业的所得税申报是否准确。

4. 税务调解：如果税务机关发现企业存在所得税申报不准确、漏报、逃税等问题，会与企业进行调解，要求企业补缴税款和罚款。

5. 税务处罚：如果企业拒不配合税务机关的检查、调查和调解，或者存在严重的逃税行为，税务机关可以对企业进行税务处罚，包括罚款、税务追缴、行政处罚等。