首先，对于环境科学专业的考生来说，选择二级建造师的市政或机电专业进行考试都是可行的。以下是针对两个专业考试难度的一些分析，希望对您有所帮助。

1. 市政工程专业：

市政工程主要涉及城市基础设施，如道路、桥梁、给排水、燃气等。对于环境科学专业的考生来说，市政工程与环境保护有一定关联，部分内容可能会相对熟悉。

考试难度：市政工程考试内容较为广泛，但相对较为浅显易懂。对于初学者来说，理解和掌握相关知识可能较为容易。

2. 机电工程专业：

机电工程涉及建筑设备、电力、自动化等领域的知识。环境科学专业的考生可能对此部分内容较为陌生，需要付出更多的努力去学习。

考试难度：机电工程考试内容较为专业，技术性较强。对于非专业人士来说，可能需要更多的时间和精力去准备。

综合比较：

考虑到您的专业背景，市政工程专业可能更容易上手，内容相对易懂。但具体选择还需根据以下几点进行判断：

1. 个人兴趣：了解自己对哪个专业更感兴趣，兴趣是最好的老师。

2. 工作需求：考虑未来求职方向，选择市场需求较大的专业。

3. 学习能力：评估自己在短时间内掌握新知识的能力，选择相对容易的专业。

建议：

根据以上分析，如果您对市政工程较为感兴趣且希望考试相对容易，可以选择市政工程专业。但如果您对机电工程有强烈的学习意愿，也不妨尝试挑战。

最后，无论选择哪个专业，都要认真备考，相信您一定能取得好成绩。祝您考试顺利！