浙江市政二级建造师初始兼职挂靠的付费方式，通常由双方协商确定。根据行业惯例，兼职挂靠费用的支付有以下几种方式：

1. 一次性付清：在签订兼职挂靠协议时，双方可以约定将三年的挂靠费用一次性付清。这种方式对于挂靠方来说，可以减少后续支付的麻烦，同时也便于双方在协议期内保持稳定的合作关系。

2. 分年支付：也可以选择按年度支付挂靠费用，每年支付一次。这种方式可以让双方在每年结束时根据合作情况进行评估，决定是否继续合作。

至于您能否要求一次付清，这主要取决于您与对方签订的协议。以下建议供您参考：

1. 在签订协议前，与对方充分沟通，了解行业惯例以及双方的需求和期望。
2. 在协商过程中，明确提出您的需求，包括一次性付清的意愿。
3. 双方达成一致后，将支付方式明确写入兼职挂靠协议中，以保障双方的权益。

请注意，无论选择哪种支付方式，都要确保协议条款公平、合理，并遵守国家相关法律法规。希望以上回答对您有所帮助。如有其他疑问，请随时提问。祝您工作顺利！