收购企业可以选择评估价入账或协议价入账，具体取决于收购方的财务策略和税务规划。

评估价入账是指将收购企业的资产和负债按照公允价值计量，并将差额计入企业的账面价值。这种方法可以反映出实际的财务状况，但是需要进行评估，评估费用较高，且可能存在评估误差。

协议价入账是指将收购企业的资产和负债按照收购协议中约定的价格计量，并将差额计入企业的账面价值。这种方法操作简单，但可能不能反映出实际的财务状况。

在税务规划方面，评估价入账可能会导致更高的税负，因为公允价值通常会高于协议价值，而协议价入账则可能会导致税务问题，因为税务部门可能会认为协议价过低，从而认定企业存在避税行为。

因此，收购企业应该根据自身的实际情况和财务策略选择适合的入账方法，并在税务方面进行合理规划。