尊敬的老师，您好！

关于您咨询的购买别墅涉及的税费问题，以下是根据当前政策整理的详细解答：

1. 契税：根据我国相关政策，购买住宅需要缴纳契税。江苏地区的契税税率通常为房屋交易价格的1%-3%。对于您所购买的500万别墅，契税大约在5万-15万之间。

2. 房产交易手续费：购房者在办理房产过户手续时，需要支付房产交易手续费。江苏地区的收费标准一般为房屋交易价格的0.05%，即2.5万。

3. 房产测绘费：购房者在办理房产证时，需要支付房产测绘费。费用标准因地区而异，一般在1000元-2000元之间。

4. 房产证工本费：办理房产证时，需要支付房产证工本费。目前的标准为80元/本。

5. 土地增值税：江苏地区在房产交易中，土地增值税的征收标准为房屋交易价格的1%。对于您所购买的别墅，土地增值税大约为5万。

6. 个人所得税：如果您购买的别墅为B的满五年唯一住房，且B为个人出售，则免征个人所得税。否则，需按照房屋交易价格的1%或者差价的20%征收个人所得税。

综上所述，A在购买B手上的别墅时，除了支付500万的房款，还需支付以下税费：

- 契税：5万-15万
- 房产交易手续费：2.5万
- 房产测绘费：1000元-2000元
- 房产证工本费：80元
- 土地增值税：5万
- 个人所得税：视情况而定，可能免征或按交易价格1%征收

请注意，税费具体数额可能会因政策调整和地区差异而有所不同，建议在办理过户手续前向当地税务机关咨询详细情况。希望这些信息对您有所帮助，如有其他疑问，请随时提问。祝您购房顺利！