在财务报表中，研发费用的处理方式会根据会计准则和公司的内部管理政策有所不同。以下是针对您的问题的详细解答：

1. 利润表中的研发费用：

通常情况下，利润表中的研发费用是指当期发生的研究与开发支出中，按照会计准则确认为费用的部分。这通常包括未资本化的研发支出。资本化支出是指公司认为符合资本化条件的研发支出，这些支出不会在当期全部费用化，而是分摊到多个会计期间。

: 答案是：利润表中的研发费用通常不包括资本化支出部分。资本化支出会在资产负债表中体现，作为长期资产（如无形资产）的一部分。

2. 所得税汇算清缴研发费用加计扣除：

在中国，根据税收政策，企业可以对其研发费用进行加计扣除，以减少应纳税所得额。这一政策旨在鼓励企业加大研发投入。

关于是否应包括资本化支出部分，根据国家税务总局的相关规定，研发费用加计扣除主要针对的是费用化的研发支出。资本化的研发支出在形成无形资产时不直接参与加计扣除，因为这部分支出已经在资产的摊销过程中得到了税前扣除。

: 答案是：所得税汇算清缴研发费用加计扣除通常不包括资本化支出部分。这是因为资本化支出已经通过资产的摊销在多个年度中进行了税前扣除。

总结：

在处理利润表中的研发费用和所得税汇算清缴的研发费用加计扣除时，通常关注的是费用化的研发支出。资本化的研发支出不包含在这些费用的计算中，因为它们已经以不同的方式在财务和税务上得到了处理。

希望以上解释能够帮助您完全理解并解决您的问题。如果您还有其他疑问，欢迎继续提问。我会耐心为您解答。