公司为员工支付房租，是直接计入管理费用—职工福利费，还得根据部门分别计入相关成本费用，例如：管理费用，研发费用，生产成本，制造费用，我现在有两笔，一笔是生产部的，一笔是研发部的

根据会计原则和实践，公司支付员工房租的会计处理方式通常如下：

1. **管理费用—职工福利费**：这是一般性的处理方法，如果公司不希望或不需要对各部门的成本进行细致划分，可以将员工房租直接计入管理费用下的职工福利费。

2. **根据部门分别计入相关成本费用**：这种处理方式更为精细，能够更准确地反映各部门的成本支出。

- **生产部**：生产部员工的房租支出应当计入**生产成本**。生产成本是指生产过程中直接与产品生产有关的全部费用，包括直接材料、直接人工和制造费用。房租作为间接人工成本，通常归类于制造费用中。

- **研发部**：研发部员工的房租支出则应计入**研发费用**。研发费用是指企业进行研究与开发过程中所发生的全部费用，包括直接投入的材料、人工等，以及像房租这样的间接费用。

针对您的具体问题，以下是两笔房租支出的会计处理建议：

**生产部的房租处理**：

- 借：制造费用—房租（或其他相关明细科目）
- 贷：银行存款/现金（或其他支付房租的科目）

**研发部的房租处理**：

- 借：研发费用—房租（或其他相关明细科目）
- 贷：银行存款/现金（或其他支付房租的科目）

通过以上方式，您可以确保公司的财务报表准确地反映了各部门的成本和费用，这对于成本控制、决策分析以及税务计算都是非常重要的。

请您在处理账务时，结合公司的具体情况和会计政策，必要时还可以咨询专业的会计人员，以确保会计处理的合规性和准确性。希望我的回答能够帮到您，如果还有其他问题，请随时提问。