您好！关于您提出的问题，计提的安全费用如果计入成本，并且在期末有余额，在年度企业所得税汇算时的处理方式如下：

1. **计提安全费用的会计处理**：
根据企业会计准则，企业为了保障生产安全而发生的费用，如安全生产费、安全设施改进费等，可以在发生时计入相关成本。如果这些费用是针对特定项目的，应计入该项目成本；如果是无法明确分配到具体项目的，可以计入当期损益。

2. **期末余额的处理**：
如果期末这部分费用有余额，即已经计入成本但未实际使用，根据《企业会计准则》的规定，这部分余额通常不能直接冲减当期损益，应当结转至下一年度继续使用。

3. **年度企业所得税汇算的处理**：
- **合规性检查**：首先需要确认计提的安全费用是否符合国家税法及相关政策要求。
- **税前扣除**：如果计提的安全费用符合税法规定，可以在年度汇算时作为税前扣除的成本费用。
- **余额处理**：如果有余额，需要根据税法规定判断是否可以在税前扣除。一般情况下，未实际发生的费用不能在税前扣除。如果税务部门有明确规定可以结转至下一年度，那么可以按照规定处理。
- **税务申报**：在年度企业所得税汇算清缴时，企业应当根据税法规定和实际发生的费用情况，正确填写申报表，并将计提的安全费用及其余额情况予以说明。

4. **注意事项**：
- 确保费用真实、合理，有充分的支持文件和记录。
- 关注税务政策的变化，及时调整会计和税务处理方法。
- 如果不确定如何处理，建议咨询专业的税务顾问或会计师。

希望以上回答能够帮助您解决问题。如果有任何其他疑问，欢迎继续提问。祝您工作顺利！