公司变更法人后，营业执照号码、组织机构代码证号码和税务登记证上的号码都会发生变化。这是因为法人变更后，公司的法人身份、股东结构、经营范围等信息都会发生变化，因此需要重新申请相关证照并更新证照上的信息。新的证照号码与以前的不同，需要重新办理相关手续，例如重新开立银行账户、更新纳税申报信息等。