D、联合体造成违约,甲、乙以联合承包协议为依据对建设单位只承担约定的责任。
本题考查的知识点为“工程承发包”。 按照建筑法的规定,施下单位以联合体方式承揽建设工程的,共同承包的各方对承包合同的履行承担连带责任,与甲、乙联合承包协议中的具体约定份额无关。因此,正确答案为D。