43900
选项正确。甲公司应计入资本公积的金额=10000×(5.5-1)-10000×5.5×2%=43900(万元)。甲公司应编制的会计分录为:借:银行存款 53900 贷:股本 10000 资本公积——股本溢价 43900选项错误。