首先，中国科学技术大学的公共事务学院和管理学院确实都有MPA（公共管理硕士）招生，并且它们会根据各自的学院特色和教学资源，公布不同的MPA招生简章和培养方向。

以下是两个学院MPA项目的区别：

1. 培养方向：
- 公共事务学院MPA：更侧重于公共政策分析、公共管理以及政府治理等领域，适合未来希望在政府部门、公共政策研究机构工作的考生。
- 管理学院MPA：偏向于企业社会责任、非盈利组织管理、以及企业公共关系等方向，适合那些将来希望在企业、尤其是跨国公司或公共事业部门工作的考生。

2. 课程设置：
- 公共事务学院MPA课程可能更多地涵盖政治学、社会学、法律等方面的知识。
- 管理学院MPA课程可能更多地强调管理学、经济学、市场营销等商业管理方面的内容。

3. 师资力量和资源：
- 每个学院都有其独特的师资队伍和教学资源，公共事务学院可能拥有更多政府背景的教授和资源，而管理学院可能有更多的企业实践经验和商业资源。

如何选择：

1. 兴趣和职业规划：根据自己的兴趣和未来职业规划来选择更符合自己发展方向的MPA项目。

2. 课程内容：详细对比两个学院的课程设置，看哪个学院的课程内容更吸引你，更符合你的学习需求。

3. 师资队伍：了解两个学院教授的学术背景和研究成果，选择那些你更感兴趣或能为你职业发展提供更多帮助的师资队伍。

4. 资源和平台：考虑学院能为你提供的实践机会、交流平台和校友资源等，选择更有利于个人发展的项目。

最后，建议你可以参加两个学院举办的宣讲会或者咨询会，直接与学院老师或在校学生交流，获取第一手信息，这样有助于你做出更明智的选择。

希望我的回答能够帮助你解决问题，祝你选择顺利，学业进步！