首先，上海市委党校MPA和普通大学MPA都有其独特的优势和特点，具体选择哪个更好，需要根据您的个人需求和职业规划来决定。以下是两者之间的主要区别：

1. 培养目标：

上海市委党校MPA：主要面向党政领导干部，侧重于政治理论、公共管理、领导力等方面的培养。

普通大学MPA：培养具备现代公共管理理论和实践能力的复合型、应用型人才，适用于政府部门、企事业单位等。

2. 课程设置：

上海市委党校MPA：课程更侧重于政治理论、党的建设、领导科学等领域，同时也会涉及一定的公共管理知识。

普通大学MPA：课程涵盖公共管理、公共政策、人力资源管理、财政与金融等多个方面，更加全面。

3. 师资力量：

上海市委党校MPA：教师队伍中有很多具有丰富实践经验的党政领导干部，理论联系实际。

普通大学MPA：师资力量以学术研究和理论教学为主，具有较强的学术背景。

4. 交流与实践：

上海市委党校MPA：项目通常与政府部门、企事业单位有较紧密的合作，实践机会较多。

普通大学MPA：学校会组织各类实践活动，如实习、调研等，同时也有国际交流项目。

5. 资源优势：

上海市委党校MPA：与政府部门联系紧密，有助于学生拓展人脉资源。

普通大学MPA：学术资源丰富，有利于培养学生的研究能力和创新精神。

综上所述，上海市委党校MPA和普通大学MPA各有特点。如果您更注重政治理论学习和党政领导干部的培养，那么上海市委党校MPA可能是更适合您的选择。而如果您希望全面学习公共管理知识和技能，具备较强的实践能力，那么普通大学MPA会更为合适。

请您根据自己的职业规划和兴趣，综合考虑两者之间的区别，做出明智的选择。祝您学业有成！