1.考试内容不同

临床执业医师学习的知识主要是临床知识，公共卫生执业医师学习的知识主要是预防知识，两者考试的内容不一样；

临床执业医师考试科目：

基础综合：

生理学、生物化学、病理学、药理学、医学微生物学、医学免疫学、卫生法规、预防学、医学心理学、医学伦理学。

专业综合：

症状与体征、疾病（按照人体系统排列）：呼吸系统、心血管系统、消化系统、泌尿系统（含男性生殖系统）、女性生殖系统、血液系统、内分泌系统、精神神经系统、运动系统、儿科、传染病、性传播疾病、其他。

实践综合：

发热、胸痛、咳嗽、咳痰、咯血、呼吸困难、水肿、腹痛、恶心、呕吐、腹泻、黄疸、淋巴结肿大、发绀、头痛、意识障碍、抽搐、呕血、便血、紫癜、苍白乏力、进食梗噎（疼痛）、吞咽困难、晕厥、心脏杂音、心悸、甲状腺肿大、肝大、脾大、腹水、腹部包块、瘫痪、精神障碍、颈肩痛、关节痛、腰腿痛、异常阴道流血、血尿。

公卫执业医师考试科目：

基础综合：    

生物化学、生理学、医学微生物学、医学免疫学、药理学、医学心理学、医学伦理学、卫生法规。

临床综合：

症状与体征、疾病（呼吸系统、心血管系统、消化系统、泌尿、男性生殖系统、女性生殖系统、血液系统、内分泌系统、精神、神经系统、运动系统、儿科、传染病、性传播疾病） 

专业综合：

流行病学、卫生统计学、卫生毒理学、环境卫生学、劳动卫生与职业病学、营养与食品卫生学、妇女保健学、儿童保健学、学校/青少年卫生学、社会医学、健康教育与健康促进。

2.发展方向不同

临床执业医师的发展方向是大中医院的门诊医师和病房医师主要用来临床看病的，

共公卫生执业医师的发展方向防疫站，疾控中心主要防治公共卫生安全的。“三基”考试是各个医院自行组织的，医院自行设定时间。