结构工程师需要掌握的成本核算知识包括：

1. 材料成本：结构工程师需要了解各种建筑材料的价格和性能，以便在设计和施工过程中选择最经济、最适合的材料。

2. 劳动力成本：结构工程师需要了解不同类型工人的工资水平，以便在施工过程中合理安排人力资源，控制人工成本。

3. 设备成本：结构工程师需要了解各种施工设备的租赁和购买成本，以便在施工过程中合理使用设备，控制设备成本。

4. 运输成本：结构工程师需要了解各种材料和设备的运输成本，以便在施工过程中合理安排物流，控制运输成本。

5. 管理成本：结构工程师需要了解各种管理费用的计算方法，以便在施工过程中合理安排管理资源，控制管理成本。

6. 风险成本：结构工程师需要了解各种风险的可能性和影响，以便在设计和施工过程中合理评估风险，控制风险成本。

综上所述，结构工程师需要掌握成本核算的各个方面，以便在设计和施工过程中合理控制成本，保证项目的经济效益和质量安全。