一共有6个口岸。

1、罗湖口岸：开放时间：6:30-24:00；过关后对应：香港东铁罗湖站；

路线：东铁线路：罗湖→上水→粉岭→大和→大埔墟→大学→火炭→沙田→大围→九龙塘→旺角东→红磡→尖东。

2、福田口岸：开放时间：6:30-24:00；过关后对应：香港东铁落马洲；

路线：东铁线路：落马洲→上水→粉岭→大和→大埔墟→大学→火炭→沙田→大围→九龙塘→旺角东→红磡→尖东。

3、皇岗口岸：开放时间：全天24小时；过关口对应：无地铁只能乘搭巴士前往香港各区；

一般这里过关的都是乘坐大巴车到港的旅客为主，离福田口岸大概10分钟路程左右。

4、深圳湾口岸：开放时间：6:30-24:00

过关后对应：无地铁只能乘搭巴士前往香港各区，不过由于距离新界的天水围很久，其实可以通过在口岸的巴士坐到天水围换成西铁线。

路线：西铁线路：屯门→兆康→天水围→朗屏→元朗→锦上路→荃湾西→美孚→南昌→柯士甸→尖东→红磡。

5、文锦渡口岸：开放时间：7：00-22：00；

过关后对应：无地铁只能乘搭巴士前往香港各区，可乘坐巴士前往上水广场换成东铁，或乘坐直通巴士前往尖沙咀。

6、沙头角口岸：开放时间：7:00-24:00；

过关后对应：有跨境巴士快线换乘，目的地为港铁九龙塘站和粉岭。