1.重新测量土方量：施工单位可以重新测量土方量，确保测量数据的准确性，并与设计单位进行对比，找出偏差的原因。

2.与设计单位协商：施工单位可以与设计单位进行沟通，讨论偏差的原因，并寻求解决方案。如果是设计单位的错误导致偏差，设计单位应该承担相应的责任。

3.调整施工方案：如果测量数据与设计断面积有较大偏差，施工单位可以根据实际情况调整施工方案，确保施工进度和质量。

4.申请修改设计：如果偏差较大，施工单位可以向相关部门申请修改设计，以保证施工进度和质量。但是需要注意，修改设计需要经过相关部门的审批，时间和费用会有所增加。