医疗事故鉴定书和司法鉴定书的区别主要在以下几个方面：

1. 鉴定对象不同：医疗事故鉴定书主要针对医疗事故进行鉴定，而司法鉴定书则涉及到刑事案件、民事案件、行政案件等多个领域。

2. 鉴定目的不同：医疗事故鉴定书的目的是为了确定医疗事故的原因、责任和损失程度等问题，以便为医疗纠纷的解决提供依据；而司法鉴定书则是为了提供证据和鉴定结论，协助司法机关进行案件审理。

3. 鉴定标准不同：医疗事故鉴定书根据《医疗事故处理条例》等相关法律法规和行业标准进行鉴定，而司法鉴定书则根据相关法律法规和司法解释等进行鉴定。

4. 鉴定程序不同：医疗事故鉴定一般由医疗机构内部的专家组成的鉴定委员会进行，鉴定程序相对简单；而司法鉴定则需要经过司法机关的指定和专业鉴定机构的鉴定，鉴定程序相对复杂。

总的来说，医疗事故鉴定书和司法鉴定书都是为了解决特定问题而进行的鉴定，但鉴定对象、目的、标准和程序等方面存在差异。