首先，恭喜您决定考取二级建造师证书，这对于您的职业发展将是一个很好的提升。在实务科目的选择上，建议您根据当前的工作内容以及未来的职业规划来决定。

根据您的轨道运营公司工作背景，以下是几个推荐的实务科目：

1. 市政公用工程：轨道运营与市政公用工程密切相关，该科目涉及城市轨道交通、给排水、热力、燃气等多个方面，与您的工作内容较为贴近。

2. 机电工程：轨道运营中涉及到大量的机电设备，如信号系统、供电系统等。选择机电工程科目，有助于您在专业知识上得到进一步提升。

3. 建筑工程：虽然轨道运营与建筑工程关联度相对较低，但建筑工程科目涵盖内容广泛，包括房屋建筑、结构设计等，对您的综合素质提升有所帮助。

综合以上建议，以下是对您选择实务科目的具体建议：

1. 如果您的工作主要涉及轨道运营的维护、管理等方面，建议选择市政公用工程。

2. 如果您的工作更多关注轨道运营中的机电设备，可以选择机电工程。

3. 如果您希望提升自己在建筑工程方面的知识，也可以选择建筑工程。

请您根据自己的实际情况和兴趣进行选择，祝您考试顺利！如有其他问题，欢迎继续咨询。