尊敬的提问者，您的担忧是可以理解的。关于将二级建造师证书和章安全考核B证存放于公司，以下是相关风险的分析：

1. 证书使用风险：如果证书和章安全考核B证存放在公司，可能会导致以下问题：
- 公司可能会在您不知情的情况下使用这些证书参与项目，这可能违反相关规定，对您个人造成潜在的责任风险。
- 若公司管理人员不善，可能会导致证书遗失或损坏，从而影响您的职业发展。

2. 法律责任风险：如果公司使用您的证书参与的项目发生质量问题或安全事故，作为证书持有人，您可能会承担一定的法律责任。

3. 公司信用风险：如果公司信用不佳，可能会影响您的个人信誉，对未来的职业发展产生不利影响。

风险大小评估：
- 如果公司信用良好，内部管理规范，风险相对较小。
- 如果公司信用不佳，内部管理混乱，风险相对较大。

建议：
1. 了解公司信用和管理情况，确保公司具备良好的信誉和规范的管理制度。
2. 尽量将证书和章安全考核B证存放在自己手中，需要使用时再借给公司。
3. 若必须将证书留在公司，请确保与公司签订书面协议，明确双方的权利和义务，以降低您的个人风险。

希望以上回答能够帮助您了解相关风险，并为您提供解决问题的方法。如有其他问题，请随时提问。祝您工作顺利！