首先，作为一名一级建造师在离职后需要公司配合注销相关证件，确实可能会遇到一些复杂的情况。以下是一些建议和步骤，希望能够帮助你：

1. **了解相关政策与法规**：
- 在处理这类问题时，首先要清楚相关的政策法规。根据《中华人民共和国注册建筑师条例》及其实施细则，注册建筑师离职后，原单位应配合办理注销手续。

2. **沟通协商**：
- 与公司人力资源部门或直接上级进行沟通，了解公司不配合的具体原因。如果是误会或信息不对称导致的，耐心解释情况，提供必要的离职证明和注册建筑师证件。

3. **正式书面申请**：
- 如果口头沟通无效，应正式向公司提出书面申请，列明法律规定和你的合理要求，同时保留好申请的副本和邮寄凭证。

4. **劳动仲裁或法律途径**：
- 如果公司依然不配合，可以考虑通过以下途径解决问题：
- 劳动仲裁：向所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 法律诉讼：如果仲裁未能解决问题，可以向人民法院提起诉讼。

5. **联系注册管理机构**：
- 同时，你也可以联系注册建筑师管理机关，如住房和城乡建设部相关部门，说明情况，根据他们的指导行事。

6. **备齐资料**：
- 准备好所有可能需要的资料，包括但不限于身份证、注册建筑师证、离职证明、仲裁或诉讼文书等。

7. **保持记录**：
- 在整个过程中，保持所有的沟通和处理的记录，包括邮件、短信、通话记录等，以备不时之需。

8. **耐心与坚持**：
- 面对此类问题，需要有一定的耐心和决心，合理维护自己的权益。

最后，每个地区和具体情况可能存在差异，建议在处理过程中，也可以咨询专业的法律人士，得到更专业的指导。希望这些建议能够帮助你顺利解决问题。