清关单据和国内报关不同，主要体现在以下几个方面：

1. 报关地点不同：国内报关是在国内进行的，而清关是在海关进行的。

2. 报关程序不同：国内报关需要提供进出口货物的清单、发票、合同等文件，而清关需要提供海关申报单、运输单据、商业发票等文件。

3. 报关规定不同：国内报关需要遵守国内的进出口规定，而清关需要遵守国际贸易规定和海关规定。

4. 报关费用不同：国内报关费用相对较低，而清关费用相对较高，因为清关需要支付海关税、保险费、运输费等费用。

5. 报关时间不同：国内报关时间相对较短，而清关时间相对较长，因为清关需要进行海关查验和审批。