"已取得报关员资格并申请补证时，资格仍然有效的证明文件"是指在报关员资格证书有效期内，申请补办证书时，证明申请人的报关员资格仍然有效的文件。这份文件需要包含以下内容：

1. 申请人的姓名、身份证号码和联系方式；
2. 报关员资格证书的证书编号、发证日期和有效期；
3. 申请补证的原因；
4. 证明申请人的报关员资格仍然有效的证明，可以是最近一次考试的成绩单、报关员职业资格证书、报关员职业技能鉴定证书等；
5. 申请人签字并注明申请日期。

例如：

证明文件

申请人：张三

身份证号码：123456789012345678

联系方式：13888888888

报关员资格证书编号：BG123456

发证日期：2020年1月1日

有效期：2023年1月1日

申请补证原因：证书丢失

本人证明，张三已取得报关员资格证书，证书编号为BG123456，发证日期为2020年1月1日，有效期至2023年1月1日。在申请补证时，张三的报关员资格仍然有效。

此证明文件由张三本人签字并注明申请日期：2021年6月1日。