是的，机械设备租赁企业需要办理安全生产许可证。根据《中华人民共和国安全生产法》和《安全生产许可证实施办法》，从事危险化学品生产、储存、使用、经营、运输、销售等活动的单位，以及从事烟花爆竹、煤矿、金属非金属矿山、建筑施工、特种设备、危险废物处置等高风险行业的单位，都需要办理安全生产许可证。机械设备租赁企业虽然不属于高风险行业，但也需要确保其设备的安全运行，因此也需要办理安全生产许可证。