建筑工程施工现场卫生与防疫工作应遵循以下原则：

1. 建立健全卫生防疫制度：制定卫生防疫制度和操作规范，明确责任人员和操作流程，确保施工现场的卫生防疫工作有序开展。

2. 加强施工现场卫生管理：保持施工现场的清洁卫生，及时清理垃圾、污水等，避免污染环境。加强消毒工作，对施工现场、办公室、生活区等进行定期消毒，确保环境卫生。

3. 加强施工人员健康管理：建立健康档案，对施工人员进行体温检测和健康监测，发现异常情况及时隔离和处理。加强个人卫生宣传教育，提高施工人员的卫生意识和自我保护能力。

4. 加强施工现场安全管理：加强施工现场安全管理，确保施工人员的人身安全。加强工器具、设备等的安全管理，防止安全事故发生。

5. 充分发挥监理单位的监督作用：监理单位应加强对施工现场卫生防疫工作的监督和检查，及时发现问题并提出整改意见。同时，监理单位也应加强自身的防疫工作，确保监理人员的健康安全。