尊敬的提问者，关于注册会计师如何控制函证的问题，以下是我为您总结的详细解答：

1. 核对信息：
注册会计师在实施函证过程中，首先需要将被询证者的名称、地址与被审计单位的相关记录进行核对，以确保函证的准确性。同时，还需将询证函中列示的账户余额或其他信息与被审计单位的有关资料进行核对。

2. 直接发送函证：
函证函经被审计单位盖章后，注册会计师应直接发出，避免函证过程中出现信息泄露或篡改的情况。在询证函中，应指明回函直接寄送至接受审计业务委托的会计师事务所。

3. 控制函证的发送与回收：
注册会计师应直接控制询证函的发送和回收过程，确保函件能够准确、及时地送达被询证者，并将收到的回函及时形成工作底稿。

4. 函证对象和函证方式的选择：
注册会计师应根据应收账款的重要性、被审计单位内部控制的强弱、以前期间的函证结果等因素，选择适当的函证对象和函证方式。一般情况下，应选择大额或账龄较长的项目、与债务人发生纠纷的项目、关联方项目等作为函证对象。

5. 替代审计程序：
如果注册会计师认为函证很可能是无效的，可以实施替代审计程序，获取充分、适当的审计证据。

通过以上措施，注册会计师可以确保函证过程的准确性和可靠性，为审计工作提供有力的支持。希望这些信息对您有所帮助，如有其他问题，请随时提问。祝您工作顺利！