消防工程师与建造师能否同时兼职注册于同一单位，答案是：可以的。

具体解释如下：

1. 根据我国相关法规，消防工程师和建造师是两个不同的职业资格，分别由公安部和住建部管理。它们在职责范围、注册条件等方面各有侧重，但并无明确法律规定这两个资格不能同时注册。

2. 由于消防工程师和建造师的注册系统不联网，两者之间不存在冲突。这意味着，一个人可以在满足各自注册条件的前提下，同时持有这两个资格，并在同一单位兼职。

3. 需要注意的是，即使在同一单位，也要确保所从事的工作岗位不相互制衡。例如，建造师和监理师由于岗位之间存在制衡关系，不能同时注册。但消防工程师和建造师在职责上并无此类冲突，因此可以同时兼职。

4. 对于二级建造师和二级消防工程师，同样可以同时注册。但在实际操作中，需确保满足各自的注册条件和继续教育要求。

综上所述，消防工程师和建造师可以同时兼职注册于同一单位。在回答此类问题时，请务必确保准确理解相关法规和政策，以免误导提问者。希望以上解答能够帮到您，如有其他疑问，请随时提问。