首先，关于你的情况，由于你已经与武汉铁路局签订了就业协议书，这份协议通常会对双方的权益进行明确规定，包括违约责任等。

1. 关系界定：即使你已完成实习并领取了档案和毕业证，只要就业协议书仍然有效，你就与武汉铁路局保持着合同关系。这意味着，如果协议中有规定在实习结束后继续履行的条款，你需要遵守这些条款。

2. 违约金问题：
- 如果就业协议书中明确规定了你若不在武汉铁路局工作需支付违约金，那么在协议有效期内，你改变就业意向可能需要按照约定支付违约金。
- 如果协议中未提及违约金或未规定相关违约责任，那么你可能不需要支付违约金。
- 另外，如果协议中规定了试用期或者有特殊条款，需要具体分析协议内容来确定责任。

为了确保回答的准确性，以下是一些建议：

- 仔细阅读就业协议书的内容，特别是关于违约责任的部分。
- 如果对协议内容有疑问，可以咨询法律专业人士，获得准确的法律意见。
- 考虑与武汉铁路局进行沟通，说明自己的情况，有时双方可以通过协商解决违约金的问题。

请记住，任何合同或协议的解释应以法律为准，并且应当尊重双方的合法权益。

最后，对于你的情况，建议采取以下步骤：

- 重新审视就业协议书，确定其中关于违约的具体规定。
- 如果存在违约行为，应主动与武汉铁路局联系，了解可能的责任和解决方案。
- 如果有必要，寻求法律援助，以便更专业地处理这一问题。

希望我的回答对你有所帮助，祝你顺利解决问题！