案例：某市政工程项目的监理工程师在施工过程中发现，承包商在施工中使用了不符合规范的材料，且施工质量存在较大问题。监理工程师立即向业主和承包商提出整改要求，但承包商拒绝整改，并威胁监理工程师不要干涉施工。监理工程师该如何处理？

分析：监理工程师是工程建设项目的监督者和管理者，其职责是保证工程建设的合法性、规范性和安全性。在发现承包商存在违规行为时，监理工程师应及时采取措施，要求承包商整改，并向业主报告情况。如果承包商拒绝整改，监理工程师应当采取进一步的措施，保证工程建设的质量和安全。

解答：监理工程师应当采取以下措施：

1. 向业主报告情况。监理工程师应当向业主详细汇报承包商的违规行为和施工质量问题，说明整改要求和承包商的拒绝情况。业主有权利要求承包商整改，监理工程师应当支持业主的决定。

2. 向有关部门报告情况。如果承包商的违规行为涉及到法律法规的问题，监理工程师应当向有关部门报告情况，要求执法部门介入处理。

3. 坚持原则，不退缩。承包商的威胁和压力是常见的，但监理工程师应当坚持原则，不退缩。监理工程师应当通过法律途径保护自己的权益，同时保证工程建设的质量和安全。

总之，监理工程师应当积极履行职责，保证工程建设的质量和安全，维护公共利益和社会公正。