公司在代交职工医疗保险、养老保险等费用时，会计分录的处理需要遵循以下规定：

1. 借记“应付职工薪酬”科目，贷记“银行存款”或“库存现金”等科目，记录公司实际支付的费用。

具体分录如下：

借：应付职工薪酬——医疗保险（或养老保险）
贷：银行存款/库存现金

2. 在支付社会保险费时，还需要计提职工应负担的社会保险费部分，此时会计分录如下：

借：管理费用（或其他相关费用科目）
贷：应付职工薪酬——医疗保险（或养老保险）

3. 当公司从职工工资中代扣代缴社会保险费时，会计分录如下：

借：应付职工薪酬——工资
贷：应付职工薪酬——医疗保险（或养老保险）

通过以上分录，可以确保公司代交的职工医疗保险、养老保险等费用得到准确、规范的会计处理。

需要注意的是，不同公司的会计科目设置可能会有所不同，具体分录应根据公司的实际情况和会计政策进行调整。如有疑问，建议咨询专业的会计人员或会计师事务所。

希望以上回答能帮助您解决问题，如有其他疑问，请随时提问。我会耐心为您解答。祝您工作顺利！